Influence des propriétés physiques et chimiques du sol et de leur variation saisonnière sur l’occurrence et la distribution de Burkholderia pseudomallei dans une rizière au centre du Laos

Soutenance de thèse de Khemngeun PONGMALA

Burkholderia pseudomallei (BP) a pathogenic bacterium found in tropical soils, causes a severe disease, melioidosis. This thesis, based on field work in the main region of BP endemicity in Lao PDR, aims to clarify the determinants of BP distribution in soil. We applied a multi-scale approach to characterize the distribution of BP in relation with soil physico-chemical variability and highlight seasonal variations in BP distribution. BP occurred at all soil depths down to 300 cm but its concentrations varied drastically, both at the millimetre scale, concomitantly with the oxidation state of iron, and at the soil profile scale, unexpectedly reaching peak values below 100 cm. Seasonal variability of BP concentrations was higher in shallow than deep soil horizons, consistent with increased BP persistence in layers saturated with water year round.  This thesis demonstrates the importance of considering the complexity of soil to better understand the ecology of BP. 

Le jury sera composé de :
M. Jean MARTINS (Directeur de recherche – CNRS, IGE, Rapporteur)
M. Christian VALENTIN (Directeur de recherche émérite – IRD, iEES-Paris, Rapporteur)
M. Naoise NUNAN (Directeur de recherche – CNRS, iEES-Paris, Rapporteur)
Mme Fabienne NEULAT-RIPOLL (Chargée de recherche – IRBA, Examinatrice)
Mme Laurie BOITHIAS (Physicienne-adjointe – Université Toulouse III, GET, Examinatrice)
M. Olivier RIBOLZI (Directeur de recherche – IRD, GET, Directeur de thèse)
M. Alain PIERRET (Chargé de recherche – IRD, iEES-Paris, Co-directeur de thèse)
Mme Amphone VONGVIXAY (Professeur associé – Faculté de Génie Civil, NUOL, Co-directeur de thèse)